生物样本库平台

原代肿瘤细胞样本库
上海张江生物银行建立原代肿瘤细胞样本库
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早癌样本库
上海张江生物银行建立标准化早癌样本库
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Hp耐药菌株库
建立HP耐药菌株库等重大专病生物样本库
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肠道微生物样本库
肠道微生物样本库
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组织芯片定制服务

       提供食管癌、胃癌、大肠癌、结肠癌、直肠癌、肝癌、肺癌、肾癌等多种肿瘤组织和癌旁组织的芯片定制。

组织芯片简介
组织芯片分类
组织芯片方法原理
组织芯片应用
组织芯片优势
组织芯片简介
组织芯片简介

       组织芯片与基因芯片、蛋白质芯片及细胞芯片等一样,属于一种特殊、新型的生物芯片,是一种新型的高通量、多样本的研究工具。它将数十个甚至上千个不同个体的组织标本集成在一张固相载体上,为医学分子生物学提供了一种高通量、大样本以及快速的分子水平的分析工具。研究者一次可有效利用成百上千份自然或出于疾病状态下的组织标本来研究特定基因及其所表达的蛋白质与疾病之间的相关关系,对于疾病的分子诊断,预后指标和治疗靶点的定位,抗体和药物的筛选等方面均有十分重要的实用价值。


组织芯片分类
组织芯片分类概念介绍
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组织芯片方法原理

组织芯片方法原理

        1. 选取待研究的组织蜡块

        2. 经病理专家诊断后标记出待研究的区域

        3. 使用组织芯片点样仪将标记好的组织按设计排列在空白蜡块上

        4. 使用切片机对阵列蜡块进行连续切片即获得组织芯片

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组织芯片应用
组织芯片应用

        1. 细胞表型分析

        用组织芯片技术可以对细胞进行高通量免疫表型分析。用标准的免疫组化法对组织芯片上的数百甚至上千例不同的肿瘤组织标本进行各种指标的检测,不但可用于发现这些指标与肿瘤的诊断、鉴别诊断和预后密切相关,而且与完整的大组织切片相比,不同部位点样构建的组织芯片便可以提供一个可靠的高通量免疫组化表型分析系统。

        2. 与基因芯片联合应用

        用组织芯片技术也可以同时进行数种或数十种基因扩增、表达的检测,可用于发现多种组织样本中不同基因的调控,再根据这些不同的调控情况得出有价值的实验结果。

        3. 用于新基因靶点筛选

        组织芯片技术亦可用于寻找治疗肿瘤的新靶点。用组织芯片对每个候选基因进行分析可以发现最有潜力成为新药或抑制剂的靶基因,或发现原癌基因或编码信号转导分子的新基因。如果某种特殊基因过度表达或在许多肿瘤中表达增强,则此基因即可作为一种重要的靶基因,那么干扰这种基因的表达或其表达产物功能的物质可能就是极有潜力的新药。所以,肿瘤组织芯片特别适合于研制抗肿瘤药物时先对靶基因进行选择。

        4. 缩微组织学和病理学图谱

        根据需要可制备各种缩微组织学和病理学图谱。如制备各种正常组织芯片、各种病理类型的肿瘤组织芯片、同一系统中的各种肿瘤组织芯片、少见肿瘤组织芯片、疑难病例组织芯片、多种炎症组织芯片、不同寄生虫组织芯片以及胚胎发育组织芯片。可用于进修、学习、存储和进行对比研究等。

        5.基因扩增分析

        用组织芯片技术也可以同时进行数种或数十种基因扩增、表达的检测,可用于发现多种不同组织样本中各种基因的调控,再根据这些不同的调控情况得出有价值的实验结果。

        6. 抗体筛选

        在各种疾病研究中,疾病相关抗体和探针是必不可少的研究工具,其特异性敏感性对研究结果影响巨大。对抗体和探针测试的基本方法就是用大量不同来源的阳性和阴性组织进行检查。对此,传统病理学方法需做大量单一切片。如果采用组织芯片技术,一次实验即可完成。现在组织芯片技术已经成为生物制品公司、病理医生和研究者筛选抗体和探针的必备工具。

        7.用于个体化肿瘤治疗

        组织芯片可用于筛选大量的肿瘤组织标本来确定哪些肿瘤应采取何种治疗方式。如对乳腺癌进行HER-2基因的筛选,搞表达或者扩增的患者Herceptin治疗将有良好的效果。

组织芯片优势

       高通量—一次即获大量信息,成百上千倍地提高效率

       并行化—可比性强、准确性高

       实验误差小—实验条件保持一致

       便于设置各种实验对照

       大量缩减研究费用

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肿瘤原代细胞样本库
肿瘤原代细胞样本库

      上海张江生物银行是建立肿瘤原代细胞样本库。肿瘤原代细胞是由肿瘤组织或肿瘤细胞进行的首次培养,也叫初代培养。目前上海张江生物银行具有多种肿瘤原代细胞,其中来源包括食管癌、胃癌、大肠癌、结肠癌、直肠癌、肝癌、肺癌、肾癌等多种肿瘤类型。

肿瘤原代细胞应用方向

      原代肿瘤细胞具有多种应用方向,其中包括原代细胞培养,原代细胞切片,原代肿瘤细胞pannel等应用方向。

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早癌样本库
早癌样本库简介

       上海张江生物银行建立标准化早癌样本库。目前组织库在库样本约50万份,包含肿瘤样本,癌旁样本及正常组织样本,其中肿瘤样本包括食管癌、胃癌、大肠癌、结肠癌、直肠癌、肝癌、肺癌、肾癌等多种临床样本。细胞库在库样本包括人肿瘤组织原代细胞等。通过临床研究与转化研究的坚强基石,以快速高效地实现相关疾病的个性化精准诊疗,从而实现疾病预测、预防、早筛、早诊。   

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HP幽门螺杆菌及其耐药菌株库
HP 耐药菌株库简介

        上海张江生物银行是首家第三方HP耐药菌株库,旨在推动我国幽门螺杆菌个性化精准诊疗与系列分子水平研究(基因组、耐药基因、胃癌遗传易感性、非抗生素疗法等),同时建立等HP耐药菌株库等重大专病生物样本库,成为上海张江生物银行临床研究与转化研究的坚强基石,以快速高效地实现幽门螺杆菌及其相关疾病(包括胃癌)的个性化精准诊疗:预测、预防,早筛、早诊与个性化治疗。

耐药菌株检测标准

        HP菌株可分为敏感菌株与耐药菌株。

        通常根据药物敏感实验抑菌圈直径来检测HP耐药菌株。

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其他检测方法

        HP耐药基因突变检测

        HP全基因组突变位点检测

常见HP耐药菌株基因突变位点

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肠道微生物样本库
肠道微生物样本库简介

        人体肠道微生物的数量超过人体自身细胞的10倍以上,对营养物质代谢、人体自身发育、免疫及疾病的产生等方面都起到极其重要的作用。研究表明肠道微生物和多种疾病发病直接相关,比如癌症、肥胖、神经变性疾病等。尤其近年来炎症性肠炎的高发,与自身免疫系统具有重要关系,建立肠道微生物样本库,通过对肠道微生物的测定,生物信息学统计分析,对大量数据进行处理,实现临床研究与转化研究有着重要的意义。


肠道微生物样本库类型

健康人群和疾病人群队列:
        建立健康人群和疾病人群的粪便样本队列,对比健康组和疾病组之间肠道菌群的差异,寻找与疾病相关的marker。

药物(或饮食)干预群体的肠道菌群:
        建立药物(或饮食)干预前、后的群体的粪便样本队列,寻找个体在不同干预阶段的肠道菌群的差异。

同一群体、不同生长发育时期的肠道菌群:
        如分别采集婴儿出生后0个月、4个月、12个月等时间的粪便样本,对婴幼儿的肠道菌群进行研究。

研究某一疾病发生发展进程中的群体的肠道菌群:
        如分别选择健康人、结直肠腺瘤患者(大部分的结直肠癌由腺瘤演变而来)、结直肠癌患者群体,研究与结直肠癌疾病进程相关的marker。

研究同一群体多个身体部位的微生物:
        如分别选取同一人群的粪便、唾液、牙菌斑等样本进行关联分析。