组织芯片与基因芯片、蛋白质芯片及细胞芯片等一样，属于一种特殊、新型的生物芯片，是一种新型的高通量、多样本的研究工具。它将数十个甚至上千个不同个体的组织标本集成在一张固相载体上，为医学分子生物学提供了一种高通量、大样本以及快速的分子水平的分析工具。研究者一次可有效利用成百上千份自然或出于疾病状态下的组织标本来研究特定基因及其所表达的蛋白质与疾病之间的相关关系，对于疾病的分子诊断，预后指标和治疗靶点的定位，抗体和药物的筛选等方面均有十分重要的实用价值。

        1. 选取待研究的组织蜡块

        2. 经病理专家诊断后标记出待研究的区域

        3. 使用组织芯片点样仪将标记好的组织按设计排列在空白蜡块上

        4. 使用切片机对阵列蜡块进行连续切片即获得组织芯片。

        1. 细胞表型分析

        用组织芯片技术可以对细胞进行高通量免疫表型分析。用标准的免疫组化法对组织芯片上的数百甚至上千例不同的肿瘤组织标本进行各种指标的检测，不但可用于发现这些指标与肿瘤的诊断、鉴别诊断和预后密切相关，而且与完整的大组织切片相比，不同部位点样构建的组织芯片便可以提供一个可靠的高通量免疫组化表型分析系统。

        2. 与基因芯片联合应用

        用组织芯片技术也可以同时进行数种或数十种基因扩增、表达的检测，可用于发现多种组织样本中不同基因的调控，再根据这些不同的调控情况得出有价值的实验结果。

        3. 用于新基因靶点筛选

        组织芯片技术亦可用于寻找治疗肿瘤的新靶点。用组织芯片对每个候选基因进行分析可以发现最有潜力成为新药或抑制剂的靶基因，或发现原癌基因或编码信号转导分子的新基因。如果某种特殊基因过度表达或在许多肿瘤中表达增强，则此基因即可作为一种重要的靶基因，那么干扰这种基因的表达或其表达产物功能的物质可能就是极有潜力的新药。所以，肿瘤组织芯片特别适合于研制抗肿瘤药物时先对靶基因进行选择。

        4. 缩微组织学和病理学图谱

        根据需要可制备各种缩微组织学和病理学图谱。如制备各种正常组织芯片、各种病理类型的肿瘤组织芯片、同一系统中的各种肿瘤组织芯片、少见肿瘤组织芯片、疑难病例组织芯片、多种炎症组织芯片、不同寄生虫组织芯片以及胚胎发育组织芯片。可用于进修、学习、存储和进行对比研究等。

        5.基因扩增分析

        用组织芯片技术也可以同时进行数种或数十种基因扩增、表达的检测，可用于发现多种不同组织样本中各种基因的调控，再根据这些不同的调控情况得出有价值的实验结果。

        6. 抗体筛选

        在各种疾病研究中，疾病相关抗体和探针是必不可少的研究工具，其特异性敏感性对研究结果影响巨大。对抗体和探针测试的基本方法就是用大量不同来源的阳性和阴性组织进行检查。对此，传统病理学方法需做大量单一切片。如果采用组织芯片技术，一次实验即可完成。现在组织芯片技术已经成为生物制品公司、病理医生和研究者筛选抗体和探针的必备工具。

        7.用于个体化肿瘤治疗

        组织芯片可用于筛选大量的肿瘤组织标本来确定哪些肿瘤应采取何种治疗方式。如对乳腺癌进行HER-2基因的筛选，搞表达或者扩增的患者Herceptin治疗将有良好的效果。